Cụ thể, Thông tư đưa ra một số quy định chung trong việc lập dự toán, quản lý sử dụng và quyết toán kinh phí ngân sách nhà nước thực hiện nhiệm vụ khoa học và công nghệ, được căn cứ theo các Nghị định của Chính phủ, áp dụng với các cơ quan quản lý nhiệm vụ khoa học và công nghệ, các cơ quan có thẩm quyền phê duyệt nhiệm vụ khoa học và công nghệ có sử dụng ngân sách nhà nước, các tổ chức, cá nhân thực hiện nhiệm vụ khoa học và công nghệ có sử dụng ngân sách nhà nước và các tổ chức, cá nhân khác có liên quan. 

Đối với việc xây dựng dự toán ngân sách nhà nước thực hiện nhiệm vụ khoa học và công nghệ, Bộ Tài Chính đề nghị các đơn vị cần phải tập trung vào một số quy định chính như sau: các yếu tố đầu vào cấu thành dự toán ngân sách nhà nước thực hiện nhiệm vụ khoa học và công nghệ (tiền thù lao tham gia nhiệm vụ; chi tiêu mua nguyên liệu, nhiên liệu, vật liệu, các sản phẩm phục vụ nghiên cứu; chi phí sửa chữa, mua sắm trang bị, cơ sở vật chất phục vụ nghiên cứu;...), khung định mức làm căn cứ xây dựng dự toán ngân sách nhà nước thực hiện nhiệm vụ khoa học và công nghệ (dự toán chi thù lao tham gia nhiệm vụ, dự toán thuê chuyên gia, dự toán chi sự kiện,...), các nội dung chi cho công tác quản lý nhiệm vụ khoa học và công nghệ (chi hoạt động của các Hội đồng tư vấn, chi hoạt động của tổ thẩm định kinh phí thực hiện nhiệm vụ, chi thù lao cho các chuyên gia,...)

Trong quá trình lập dự toán, quản lý sử dụng và quyết toán kinh phí ngân sách nhà nước thực hiện nhiệm vụ khoa học và công nghệ, các đơn vị cần xây dựng dự toán kinh phí theo hướng dẫn của Bộ Khoa học và Công nghệ cũng như căn cứ vào các định mức kinh tế - kỹ thuật do các bộ, ngành chức năng ban hành (nếu có). Thực hiện phân bổ dự toán, quản lý sử dụng kinh phí thực hiện nhiệm vụ khoa học và công nghệ theo quy định của pháp luật về ngân sách nhà nước và pháp luật về khoa học và công nghệ. Đối với các nhiệm vụ khoa học và công nghệ sử dụng ngân sách nhà nước có huy động các nguồn tài chính khác ngoài ngân sách để thực hiện, việc phân bổ nguồn ngân sách nhà nước để thực hiện các nhiệm vụ và công nghệ sẽ được căn cứ theo cơ cấu tỷ lệ với các nguồn kinh phí huy động khác ngoài ngân sách theo nhiệm vụ được phê duyệt và khả năng cân đối của ngân sách nhà nước hàng năm. 

Thông tư có hiệu lực thi hành kể từ ngày 26 tháng 2 năm 2023.